毕业论文致谢查重与正文查重的区别主要在于内容和重点。毕业论文致谢部分一般不计入论文正文范围，主要是对在写作过程中给予帮助的人或单位表示感谢，不需要进行严格的查重。而正文部分是论文的核心内容，需要保证原创性，因此对正文进行查重非常重要。在查重过程中，需要注意将致谢部分排除在外，确保正文的独立性和原创性。

另外，毕业论文致谢一般放在正文之后，是对完成论文过程中提供帮助的人表示感谢的一个环节，不会影响论文的学术性和原创性。而正文部分是论文的主体，需要经过严格的查重，确保内容的独立性和学术性。因此，在进行论文查重时，需要将致谢部分与正文部分分开考虑，避免因致谢部分的重复而影响正文的查重结果。