毕业论文致谢部分通常是作者对于在论文写作过程中给予帮助的人表示感谢的部分，不应该计入总查重率。因为致谢部分主要是表达感激之情，不具备论文原创性要求。如果致谢部分被误判为抄袭，建议向查重机构提交说明材料，说明致谢部分不应计入总查重率。

为避免毕业论文致谢部分计入总查重率造成的影响，作者在提交论文前应在查重系统中将致谢部分排除在外，以确保最终查重结果准确无误。同时，在写作过程中，也应注意保持致谢部分的真实性和诚恳性，避免出现与他人论文相似度过高的情况，以免被误判为抄袭。